云南农业大学动物医学院的前身是云南大学农学院畜牧系，始创于1950年，2017年7月成立云南农业大学动物医学院。在近70年的光阴荏苒中，几易院（系）址，多次沉浮，历经沧桑，发展至今。

以下按照年代顺序：

1950年云南大学农学院畜牧系；

1960年在小哨建立云南畜牧兽医学院；

1961年云南畜牧兽医学院、昆明农学院和昆明林学院三个学校合并为昆明农林学院小哨分院；

1964年迁至昆明农林学院本部黑龙潭成立畜牧兽医系；

1969年搬迁至大理宾川县；

1970年迁至寻甸县；

1971年2月昆明农林学院畜牧兽医系与云南农业劳动大学畜牧兽医系合并成立云南农业大学畜牧兽医系；

1979年由寻甸县迁至昆明市黑龙潭旁；

1995年成立云南农业大学动物科学技术学院；

2017年7月成立云南农业大学动物医学院。